Esta es mi interpretación personal, por eso pongo un nivel de confianza bajo.

Me baso en el sentido de "vedar", que normalmente significa "prohibir", pero veo que "vedar" aparece en documentos antiguos con el sentido de "vigilar", por ejemplo:


http://www.moderna1.ih.csic.es/zorita/FMPro?-db=zorita.fp5&-...
"...algunas personas desta villa nos habían hecho rrelaçión que habiendo disposición para poner olivares, el conçejo lo habíais fecho vedar para que se hiziese monte, y que no guardábades los olivares que allí estaban puestos,..."

http://webs.ucm.es/BUCM/tesis/19972000/H/0/H0051704.pdf
"Y por cuanto por la buena ley y correspondencia que ha tenido el reino de Aragón con el de Navarra, franqueándole los derechos de salida de todo lo que (se) fabrica en su país, le ha correspondido con prohibir y vedar para que no se pueda entrar vino de Aragón,"

También se utiliza actualmente de forma incorrecta con este sentido. Debería decir "velar por". Ejemplos:

Presentación Premios Hábitat 2021 | By Canal Sur Loja
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... vedar para que todos esos proyectos se hagan realidad, beneficio de todos los del Ecuador.

01-09-2021-COMISIÓN DE ASUNTOS AGROPECUARIOS-
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... vedar para que que no pesquen,

Creo que esto nos da una base suficiente para interpretar el texto de modo que tenga sentido:

"...no hemos de quebrar el cerebro al demonio; y esto lo haremos si vigilamos para que se aparte del nuestro, y no lo mueva mediata o inmediatamente, cuando nos retraemos a lo alto del recogimiento."

Dicho en términos actuales, el autor recomienda "quebrantar/quebrar el cerebro en el recogimiento" es decir vaciar la mente en la meditación para abrirla a Dios. Recomienda igualmente no abrir la mente al demonio, y para ello hay que velar o vigilar para que se aparte de nuestra mente y no ejerza sobre ella ninguna influencia mediata o inmediata.